Указ президента от 2001 говорит, что обязательно, Но Вам Указы президента, как и прочие Законы не писаны...
А причем тут указ ? Это не закон, а подзаконный нормативно-правовой акт, который только регулирует порядок осуществления помилования через ходатайства, но он ни в коем случае не может хоть как-то ограничивать нормы установленные законом, а тем более основным законом - Конституцией. Собственно Конституцию не могут ограничивать даже все остальные законы, на то она и основной закон. Напомню, что у нас нормы Конституции имеют прямое действие. А в Конституции ничего нету про обязательность ходатайств.