за пятнадцать+ лет умалчивать правду потеряло смысл , и политически и репутационно в связи с снятием устаревшей ракеты с ее конструктивными скажем так "родимыми пятнами"
вот вам правда от первого лица.

Майор в отставке, служивший командиром стартовой батареи "двухсотки", Михаил рассказывает, что учения шли по плану: "А когда прошла стрельба, всех командиров вызвали на рабочие места и через три часа объявили, что, по предварительным данным, наша ракета сбила пассажирский самолет. Когда на следующий день главком Ткачев объявил, что ракета не наша, я не поверил. Тем более, увидев в новостях обломки самолета, я сразу узнал отверстия от С-200".
"Реальная мишень находилась низко и пропадала из виду, а самолет был виден хорошо. Людей дергали: "Когда будет С-200? Там же иностранцы ждут". У лейтенанта, который производил пуск, даже руки дрожали. И когда в очередной раз мишень засветилась, ракету запустили. Она должна была лететь 3 минуты до мишени, а до самолета летела минут 20. За это время они могли понять, что пальнули не туда и подорвать ракету

.

Но «Комсомолке» удалось разыскать человека, экс-полковника СБУ Сергея Ивановича Балабанова, который вел расследование с украинской стороны. Сегодня он впервые рассказал нам то, что на Украине знали только генералы (и то не все) и президент.
......
- Расчет доложил на КП генерал-лейтенанту Владимиру Дьякову (тогда заместитель Главкома ПВО Украины по боевой подготовке, руководитель учений), что наводка сорвана, ракета на цель не вышла. Но Дьяков по каким-то причинам (скорее из-за нервозности) не дал команду на самоликвидацию ракеты. А начал «дебаты» с командиром боевого расчета. Расчет запрашивают – «ты готов второй стрелять» (имеется ввиду вторая ракета С-200 – прим. авт.)? Ответ: - «Да, готов!». Но Дьяков принял иное решение, дав команду сбить цель ракетой из зенитно-ракетного комплекса С-300, которая и сбила мишень «Рейс». Причем, этот взрыв я даже визуально наблюдал. Где-то уже на подходе к береговой черте. Если бы еще одну ракету ЗРК С-200 запустили, не исключена в таких морских условиях вероятность, что могли сбить и армянский самолет сбить (Ан-24 компании «Армавиа»), который находился так же в этом секторе, но на дальнем удалении. И, как следовало в дальнейшем из масс-медиа, якобы видевший вспышку. В итоге получилось так, что при срыве наводки, ни Владимир Дьяков, ни командир боевого расчета ЗРК С-200 майор Юрий Венгер не приняли решение немедленно убрать подсветку цели радиолокатором (РПЦ). А оператор боевого расчета «подсвечивал» Ту-154 вместо малозаметной учебной цели. Если по-простому,- это как выключить свет в комнате. В этом случае подсветка цели исчезает, ракета становится «слепой» и через считанные секунды срабатывает самоликвидатор на уничтожение ракеты.

причина катастрофы штатный перезахват ПАРГСН ракеты в воздухе при потере цели и при продолжении ее подсветки.(подсвет цели не сняли тк предполагали стрелять повторно второй ракетой, обнаружив срыв захвата ее ГСН. ) и последующее за этим рас.во.